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２００５年１０月２４日：第１９回目のデータリリース
PhaseⅠと PhaseⅡの genotype、frequency、assay データが利用可能です。一括ダウンロードは[ここから]。PhaseⅠと PhaseⅡのデータが統合されています。
| Total QC+ SNPs |
3,901,408 |
3,903,524 |
3,902,623 |
3,806,920 |
| Total Genotyped SNPs |
5,894,684 |
5,812,990 |
5,812,990 |
5,857,466 |
２００５年９月２８日：第１８回目のデータリリース
第2、6、11、14、15、21染色体の genotype、frequency、assay データのアップデート分が利用可能です。一括ダウンロードは[ここから]。これらには CEU 及び YRI サンプルについての PhaseⅡの完全なデータが含まれており、PhaseⅠと PhaseⅡのデータが統合されています。今回のリリースのサマリーは以下のとおりです。
| Chr 2 |
527,434 |
354,069 |
354,069 |
527,707 |
| Chr 6 |
385,351 |
124,729 |
124,729 |
386,208 |
| Chr 11 |
295,079 |
52,669 |
52,669 |
293,444 |
| Chr 14 |
173,577 |
65,117 |
65,117 |
170,624 |
| Chr 15 |
149,378 |
41,399 |
41,399 |
147,373 |
| Chr 21 |
86,213 |
37,932 |
37,932 |
85,417 |
| Total |
1,617,032 |
675,915 |
675,915 |
1,610,773 |
２００５年８月１７日：HapMap Phase II の初回データ公開
Phase II の初回公開分のデータが、こちらから bulk downloadダウンロードできま。このリリースは、パイロットスタディである第２染色体短腕のデータです。以前の Phase I のデータ (16c.1) を補完するもので、両者のデータファイルを結合することで完全なデータとなります。新しく６００，１８０についてタイピングが行われ、総計５４，０１６，２００のデータポイント情報が公開されています
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２００５年９月２１日：HapMapチュートリアルセッション：ASHG 2005 Annual Meeting
The Wellcome Trust と NIH/NHGRI は効率的な HapMap 利用について２時間のチュートリアルを行います。 ここでは、Dr. Aravinda Chakravarti (Johns Hopkins University)による HapMap 入門、 Dr. Mark Daly (Broad Institute)によるアソシエーション研究のための HapMap 利用、tag SNP 選択、DNA chip を利用した SNP 解析、 Dr. Lincoln Stein (CSHL)による HapMap ウエブのガイドの他、Dr. Toshihiro Tanaka (RIKEN)、 Dr. Michael Boehnke (University of Michigan)、Dr. Augustine Kong (deCODE)による HapMap の実際についてそれぞれプレゼンテーションを予定しています。
申込順1,000人まで登録を受け付けます。２００５年１０月１４日までに参加登録してください。
追加料金は不要ですが、参加者ははじめに[ここから]登録する必要があります。
詳細情報と登録はこちらから http://www.capconcorp.com/hapmaptutorial
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２００５年５月２７日：今後のデータリリース
フェーズＩのデータを詳細に解析してみると、タイピングデータが不正確なＳＮＰが存在することがわかりました。修正を施したリリースは現在準備中です。来週には公開できると考えています。問題点の詳細や、問題のあるＳＮＰのリストはここから
２００５年３月１日：第１６回目のデータリリース
国際 HapMap プロジェクトの第一段階が終了しました。５ｋｂおきに１つの common SNP を４つの ethnic group すべてについてタイピングを行いました。データはこちらからダウンロードできます。データのブラウズはこちらから。
| Genotyped SNPs |
1,073,663 |
1,044,686 |
1,044,416 |
1,034,205 |
２００５年２月７日：国際 HapMap プロジェクトはハプロタイプ地図をより高密度に作成することとしました。
３３０万ドルの追加予算により、従来想定していたものより高密度に地図を作成することができるようになりました。このマップによって、喘息、癌、糖尿病や心臓病といった疾患に関連する遺伝子をより迅速に同定することができると期待されます。
２００４年１２月１０日：genotype データにアクセスするための clickwrap agreement は必要なくなりました。ユーザーの方々は、data usage guidelines を尊重するようお願いします。参考までに、以前の agreement はこちらへ old agreement。
２００５年０２月１８日： 第 15 回のデータリリースで�
Han Chinese, Japanese, Yoruba のサンプルについての情報はここから。ジェノタイプデータの一括ダウンロードはここから。データのサマリーは。
| Genotyped SNPs |
1,050,307 |
1,015,490 |
1,015,226 |
1,003,169 |
２００４年１２月１０日： 第 14 回のデータリリースで�
Han Chinese, Japanese, Yoruba のサンプルについての情報はここから。ジェノタイプデータの一括ダウンロードはここから。データのサマリーは。
| Genotyped SNPs |
956,730 |
412,669 |
412,608 |
432,523 |
２００４年１１月１７日： HapMap データ＃１３がリリースされました。今回から、他の population のデータも掲載されています。
Han Chinese, Japanese, Yoruba のサンプルについての情報はここから。ジェノタイプデータの一括ダウンロードはここから。データのサマリーは。
| Genotyped SNPs |
856,726 |
386,323 |
386,274 |
406,783 |
２００４年１０月１２日：新しいゲノムブラウザの特徴
LD (LOD スコア、D'、r2), Heterozygosity, SNP のカバー率をブラウズすることができるようになりました。LD データのダウンロードはこちらから [URL]。ブラウザ上の overview track の表示を変更できるようになりました。SNP のアレル頻度情報が円グラフとして表示されるようになりました。
２００４年１０月１２日：このプロジェクトで用いているプロトコールを掲載しました。
Assay design, genotyping,and data submission processing protocols についての情報が追加されました。
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２００４年１０月１２日: 第 12 回のデータリリースです
752,208 SNPs (67,698,720 genotypes) についてのデータが公開されました．一括ダウンロードはこちらから．データのブラウズはこちらから．
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２００４年８月２６日：このプロジェクトの情報を追加掲載しました。項目は What is HapMap? , Origins of Haplotypes, Human Health Benefits, Populations Sampled, Ethical Issues and Data Release Policy です。
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２００４年０９月０２日: 第 11 回のデータリリースです
693,255 SNPs (62,393,760 genotypes) についてのデータが公開されました．一括ダウンロードはこちらから．データのブラウズはこちらから．
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２００４年９ﾎ２８日：ネットﾏーク機器ﾁﾓテナﾓスによる停電
Cold Spring Harbor Laboratory のネットﾏーク機器のﾁﾓテナﾓスｪ予定ｳれて｢まｷ。ｻれにｺ｢、ｱのサイトは１０ﾎ２日午後１０ｩら１０ﾎ３日午前６まで（｢ｸれもアﾁﾊカｬﾔ標ﾀ間）pでｫまｹん。ｲ不便をｨｩｯｵまｷｪ、ｲｹｾｳ｢。
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２００４年０８月１６日: 第 10 回のデータリリースです
661,094 SNPs (59,498,460 genotypes) についてのデータが公開されました．一括ダウンロードはこちらから．データのブラウズはこちらから．
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２００４年０７月２０日: 第 9 回のデータリリースです
639,110 SNPs (57,519,900 genotypes) についてのデータが公開されました．一括ダウンロードはこちらから．データのブラウズはこちらから．
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２００４年０６月１５日: 第 8 回のデータリリースです
614,030 SNPs (55,262,700 genotypes) についてのデータが公開されました．一括ダウンロードはこちらから．データのブラウズはこちらから．
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２００４年５ﾎ２７日：論 Nature Reviews Genetics に掲載ｳれまｵｽ．
Integrating ethics and science in the International HapMap Project.
Nature Reviews Genetics 2004 Jun;5(6):467-75
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２００４年５月２６日：日本のミラーサイト
HapMap ウェブのミラーサイトが日本にできました http://hapmap.jst.go.jp．科学技術振興機構(JST)により運営されています．アジア太平洋地域からスピーディなアクセスができます．
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２００４年０５月０４日: 第 7 回のデータリリースです
557,083 SNPs (50,137,470 genotypes) についてのデータが公開されました．一括ダウンロードはこちらから．データのブラウズはこちらから．
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２００４年０４月０９日: 第 6 回のデータリリースです
462,670 SNPs (41,640,300 genotypes) についてのデータが公開されました．一括ダウンロードはこちらから．データのブラウズはこちらから．
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２００４年４月１８日～２０日：国際 HapMap データ解析ミーティングが開かれる予定です．このミーティングでは HapMap プロジェクトでのデータ解析方法について議論します．たとえば，連鎖不平衡の表現方法，連鎖不平衡の特徴，ハプロタイプとハプロタイプ頻度の推定，ハプロタイプ地図を他の疾患解析研究に役立てるための方法などです．このプロジェクトに直接関係する研究者だけでなく，ほかの方々にとっても，ハプロタイプ地図作製のためのさまざまな問題点について議論を深めるよい機会です．
４月１８日 午後６時 開始（プレゼンテーションとレセプション）
４月２０日 午後３時 終了の予定です．主催は
the McKusick-Nathans Institute of Genetic Medicine/Johns Hopkins University
the National Human Genome Research Institute
詳細，参加登録，演題提出は 国際 HapMap データ解析ミーティングが開かれる予定です よりお願いします．
HapMap データを使って解析し，発表を行う場合は (www.hapmap.org/genotype/ENCODE/ ) のフィックスされたデータ（ HapMap プロジェクトと ENCODE プロジェクトのデータです）を使ってください．
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２００４年０３月０５日: 第 5 回のデータリリースです
369,784 SNPs (33,280,560 genotypes) についてのデータが公開されました．一括ダウンロードはこちらから．データのブラウズはこちらから．
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２００４年０２月０６日: 第 4 回のデータリリースです
324,613 SNPs (29,215,170 genotypes) についてのデータが公開されました．一括ダウンロードはこちらから．データのブラウズはこちらから．
- ２００４年０２月０３日: HapMap Newsのメーリングリストに参加するには announcements-request@listhost.hapmap.orgにメールするか，Listから申し込んでください．
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２００４年０１月０７日: 第 3 回のデータリリースです
274,571 SNPs (24 000,000 genotypes) についてのデータが公開されました．一括ダウンロードはこちらから．データのブラウズはこちらから．
- ２００３年１２月１８日: 'The International HapMap Project' の論文が
Nature に掲載されました！( PubMed へはこちらから)
- ２００３年１２月１６日：データ更新
218,497 SNP について，遺伝子型，アレル頻度やアッセイ方法がリリースされ，ダウンロードやブラウスができるようになりました．注：ファイルフォーマットが変更になっています．詳しくは README ファイルをご覧ください．
- ２００３年１２月１日: 各センターより合計 237,000 を超える SNP についてデータが提供されました．まもなく公開する予定です．
- ２００３年１１月１日: データリリースを開始しました！
145,554 SNP について，1300 万を超える遺伝子型のデータだけでなく，アレル頻度やアッセイ方法についてもダウンロードできるようになりました．ダウンロードの詳細はデータ，染色体部位別にみる場合はGBrowse へ．
- ２００３年１０月１日:
137,964 SNP について，1200 万を超える遺伝子型のデータが各センターより提供されました．
- ２００３年９月１日:
1100 万を超える遺伝子型のデータが各センターより提供されました．
- ２００３年８月１日:
117,000 SNP について，1000 万を超える遺伝子型のデータが各センターより提供されました．
- ２００３年７月: 信頼性チェック用の SNP
1500 SNP のデータが各センターより提供されました．
- July 1st, 2003: Submission progress
7.7 million genotypes have been submitted for analysis to the
HapMap Project as well as over 77,000 assays.
- June 25, 2003: Allele frequencies submitted to dbSNP
- June 1st, 2003: Submission progress
We now have over 6 million genotype submissions and 65,000 assays.
- May 27-28, 2003: International HapMap Meeting at CSHL
Two day meeting at Cold Spring Harbor Laboratory with representatives from all participanting groups.
- May 1st, 2003: Submission progress
3.8 million genotypes have been submitted to date and 40,000 assays.
- March 21, 2003: Conceptual Web Site up
News
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